Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2MP0CAP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms