Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax1P09084 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms