Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCAP05165 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCAP05165 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCAP05165 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCAP05165 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCAP05165 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCCAP05165 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCAP05165 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCAP05165 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCAP05165 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCAP05165 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCAP05165 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCAP05165 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCAP05165 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCCAP05165 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCAP05165 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCAP05165 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCCAP05165 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCCAP05165 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms