Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIA3O75145 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms