Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMARCA5O60264 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA5O60264 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms