Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4O43374 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4O43374 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4O43374 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4O43374 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RASA4O43374 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4O43374 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms