Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dgcr6O35347 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms