Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN3O15232 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN3O15232 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN3O15232 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN3O15232 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN3O15232 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms