Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOP56O00567 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOP56O00567 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP56O00567 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOP56O00567 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOP56O00567 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOP56O00567 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP56O00567 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP56O00567 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP56O00567 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP56O00567 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOP56O00567 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOP56O00567 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOP56O00567 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOP56O00567 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOP56O00567 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOP56O00567 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOP56O00567 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOP56O00567 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOP56O00567 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOP56O00567 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOP56O00567 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NOP56O00567 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOP56O00567 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms