Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
B4DEV8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
B4DEV8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B4DEV8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B4DEV8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B4DEV8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B4DEV8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B4DEV8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
B4DEV8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
B4DEV8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B4DEV8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms