Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOBPA7XYQ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOBPA7XYQ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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