Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYNDIG1LA6NDD5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms