Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer3W4VSP1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer3W4VSP1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer3W4VSP1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer3W4VSP1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer3W4VSP1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer3W4VSP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer3W4VSP1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer3W4VSP1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer3W4VSP1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer3W4VSP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer3W4VSP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer3W4VSP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms