Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Top3bQ9Z321 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Top3bQ9Z321 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Top3bQ9Z321 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Top3bQ9Z321 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Top3bQ9Z321 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Top3bQ9Z321 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Top3bQ9Z321 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Top3bQ9Z321 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Top3bQ9Z321 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Top3bQ9Z321 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Top3bQ9Z321 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Top3bQ9Z321 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Top3bQ9Z321 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Top3bQ9Z321 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Top3bQ9Z321 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
Top3bQ9Z321 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Top3bQ9Z321 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Top3bQ9Z321 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Top3bQ9Z321 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Top3bQ9Z321 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Top3bQ9Z321 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Top3bQ9Z321 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Top3bQ9Z321 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Top3bQ9Z321 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Top3bQ9Z321 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Top3bQ9Z321 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Top3bQ9Z321 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Top3bQ9Z321 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms