Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crlf3Q9Z2L7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Crlf3Q9Z2L7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crlf3Q9Z2L7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Crlf3Q9Z2L7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Crlf3Q9Z2L7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Crlf3Q9Z2L7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Crlf3Q9Z2L7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Crlf3Q9Z2L7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms