Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdpk1Q9Z2A0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdpk1Q9Z2A0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdpk1Q9Z2A0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdpk1Q9Z2A0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdpk1Q9Z2A0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdpk1Q9Z2A0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdpk1Q9Z2A0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdpk1Q9Z2A0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms