Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbiaQ9Z1E3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbiaQ9Z1E3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbiaQ9Z1E3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NfkbiaQ9Z1E3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NfkbiaQ9Z1E3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbiaQ9Z1E3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms