Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Padi4Q9Z183 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Padi4Q9Z183 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Padi4Q9Z183 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Padi4Q9Z183 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Padi4Q9Z183 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Padi4Q9Z183 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Padi4Q9Z183 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Padi4Q9Z183 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms