Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shcbp1Q9Z179 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shcbp1Q9Z179 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shcbp1Q9Z179 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shcbp1Q9Z179 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shcbp1Q9Z179 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shcbp1Q9Z179 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shcbp1Q9Z179 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shcbp1Q9Z179 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms