Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ror1Q9Z139 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ror1Q9Z139 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ror1Q9Z139 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ror1Q9Z139 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ror1Q9Z139 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ror1Q9Z139 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ror1Q9Z139 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ror1Q9Z139 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ror1Q9Z139 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms