Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sh3bgrQ9WUZ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms