Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MthfrQ9WU20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MthfrQ9WU20 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MthfrQ9WU20 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MthfrQ9WU20 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MthfrQ9WU20 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MthfrQ9WU20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MthfrQ9WU20 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms