Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htra1Q9R118 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Htra1Q9R118 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htra1Q9R118 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Htra1Q9R118 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htra1Q9R118 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htra1Q9R118 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htra1Q9R118 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htra1Q9R118 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htra1Q9R118 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms