Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tmed2Q9R0Q3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tmed2Q9R0Q3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tmed2Q9R0Q3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tmed2Q9R0Q3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Tmed2Q9R0Q3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Tmed2Q9R0Q3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tmed2Q9R0Q3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Tmed2Q9R0Q3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Tmed2Q9R0Q3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tmed2Q9R0Q3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Tmed2Q9R0Q3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tmed2Q9R0Q3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tmed2Q9R0Q3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tmed2Q9R0Q3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Tmed2Q9R0Q3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tmed2Q9R0Q3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Tmed2Q9R0Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Tmed2Q9R0Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Tmed2Q9R0Q3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Tmed2Q9R0Q3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Tmed2Q9R0Q3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,2 ms