Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt6Q9R0N8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt6Q9R0N8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt6Q9R0N8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt6Q9R0N8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt6Q9R0N8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt6Q9R0N8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt6Q9R0N8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt6Q9R0N8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt6Q9R0N8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt6Q9R0N8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt6Q9R0N8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt6Q9R0N8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syt6Q9R0N8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syt6Q9R0N8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt6Q9R0N8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt6Q9R0N8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt6Q9R0N8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt6Q9R0N8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt6Q9R0N8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms