Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nubp2Q9R061 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nubp2Q9R061 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nubp2Q9R061 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nubp2Q9R061 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nubp2Q9R061 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nubp2Q9R061 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nubp2Q9R061 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nubp2Q9R061 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nubp2Q9R061 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nubp2Q9R061 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nubp2Q9R061 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nubp2Q9R061 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms