Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itgb1bp2Q9R000 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb1bp2Q9R000 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb1bp2Q9R000 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb1bp2Q9R000 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb1bp2Q9R000 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itgb1bp2Q9R000 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb1bp2Q9R000 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb1bp2Q9R000 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms