Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Map1aQ9QYR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Map1aQ9QYR6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Map1aQ9QYR6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Map1aQ9QYR6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map1aQ9QYR6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Map1aQ9QYR6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Map1aQ9QYR6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Map1aQ9QYR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Map1aQ9QYR6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Map1aQ9QYR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Map1aQ9QYR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Map1aQ9QYR6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Map1aQ9QYR6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Map1aQ9QYR6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map1aQ9QYR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map1aQ9QYR6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map1aQ9QYR6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Map1aQ9QYR6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Map1aQ9QYR6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Map1aQ9QYR6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Map1aQ9QYR6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Map1aQ9QYR6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms