Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG4

Acss2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss2Q9QXG4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acss2Q9QXG4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Acss2Q9QXG4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acss2Q9QXG4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acss2Q9QXG4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acss2Q9QXG4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Acss2Q9QXG4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acss2Q9QXG4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acss2Q9QXG4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acss2Q9QXG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acss2Q9QXG4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acss2Q9QXG4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Acss2Q9QXG4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acss2Q9QXG4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Acss2Q9QXG4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acss2Q9QXG4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acss2Q9QXG4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms