Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rai2Q9QVY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rai2Q9QVY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rai2Q9QVY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rai2Q9QVY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rai2Q9QVY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rai2Q9QVY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rai2Q9QVY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rai2Q9QVY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rai2Q9QVY8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rai2Q9QVY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rai2Q9QVY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rai2Q9QVY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rai2Q9QVY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rai2Q9QVY8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rai2Q9QVY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rai2Q9QVY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rai2Q9QVY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rai2Q9QVY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rai2Q9QVY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rai2Q9QVY8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rai2Q9QVY8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms