Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Dkk3Q9QUN9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Dkk3Q9QUN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Dkk3Q9QUN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,71■■□□□ 1,39
Dkk3Q9QUN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Dkk3Q9QUN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Dkk3Q9QUN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Dkk3Q9QUN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,51■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Dkk3Q9QUN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Dkk3Q9QUN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Dkk3Q9QUN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Dkk3Q9QUN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Dkk3Q9QUN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Dkk3Q9QUN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Dkk3Q9QUN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Dkk3Q9QUN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Dkk3Q9QUN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Dkk3Q9QUN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Dkk3Q9QUN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,3 ms