Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms