Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Sorcs1Q9JLC4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Sorcs1Q9JLC4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Sorcs1Q9JLC4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Sorcs1Q9JLC4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Sorcs1Q9JLC4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Sorcs1Q9JLC4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,14■■□□□ 1,3
Sorcs1Q9JLC4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Sorcs1Q9JLC4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Sorcs1Q9JLC4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Sorcs1Q9JLC4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Sorcs1Q9JLC4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Sorcs1Q9JLC4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms