Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Irx5Q9JKQ4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx5Q9JKQ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx5Q9JKQ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx5Q9JKQ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx5Q9JKQ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx5Q9JKQ4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx5Q9JKQ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Irx5Q9JKQ4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Irx5Q9JKQ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Irx5Q9JKQ4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx5Q9JKQ4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx5Q9JKQ4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irx5Q9JKQ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx5Q9JKQ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx5Q9JKQ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Irx5Q9JKQ4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Irx5Q9JKQ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx5Q9JKQ4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Irx5Q9JKQ4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Irx5Q9JKQ4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Irx5Q9JKQ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx5Q9JKQ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx5Q9JKQ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms