Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AtrQ9JKK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AtrQ9JKK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AtrQ9JKK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AtrQ9JKK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AtrQ9JKK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AtrQ9JKK8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AtrQ9JKK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AtrQ9JKK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AtrQ9JKK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AtrQ9JKK8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AtrQ9JKK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AtrQ9JKK8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AtrQ9JKK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AtrQ9JKK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AtrQ9JKK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms