Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lmbr1Q9JIT0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmbr1Q9JIT0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmbr1Q9JIT0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lmbr1Q9JIT0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmbr1Q9JIT0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmbr1Q9JIT0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmbr1Q9JIT0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lmbr1Q9JIT0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmbr1Q9JIT0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmbr1Q9JIT0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmbr1Q9JIT0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbr1Q9JIT0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms