Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1qtnf3Q9ES30 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1qtnf3Q9ES30 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1qtnf3Q9ES30 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1qtnf3Q9ES30 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1qtnf3Q9ES30 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1qtnf3Q9ES30 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1qtnf3Q9ES30 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1qtnf3Q9ES30 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1qtnf3Q9ES30 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf3Q9ES30 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms