Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Spock2Q9ER58 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spock2Q9ER58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Spock2Q9ER58 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Spock2Q9ER58 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spock2Q9ER58 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spock2Q9ER58 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Spock2Q9ER58 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Spock2Q9ER58 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Spock2Q9ER58 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spock2Q9ER58 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spock2Q9ER58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Spock2Q9ER58 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spock2Q9ER58 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spock2Q9ER58 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spock2Q9ER58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spock2Q9ER58 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spock2Q9ER58 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Spock2Q9ER58 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spock2Q9ER58 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Spock2Q9ER58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spock2Q9ER58 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spock2Q9ER58 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spock2Q9ER58 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spock2Q9ER58 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms