Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tor1aQ9ER39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tor1aQ9ER39 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tor1aQ9ER39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tor1aQ9ER39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tor1aQ9ER39 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tor1aQ9ER39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tor1aQ9ER39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tor1aQ9ER39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms