Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr9Q9EQU3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr9Q9EQU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlr9Q9EQU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr9Q9EQU3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr9Q9EQU3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr9Q9EQU3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr9Q9EQU3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr9Q9EQU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Tlr9Q9EQU3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlr9Q9EQU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr9Q9EQU3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr9Q9EQU3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr9Q9EQU3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr9Q9EQU3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr9Q9EQU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr9Q9EQU3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr9Q9EQU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr9Q9EQU3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.9 ms