Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Yipf5Q9EQQ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf5Q9EQQ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf5Q9EQQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf5Q9EQQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf5Q9EQQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf5Q9EQQ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf5Q9EQQ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms