Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc97Q9DBT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc97Q9DBT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc97Q9DBT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc97Q9DBT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc97Q9DBT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc97Q9DBT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc97Q9DBT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc97Q9DBT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc97Q9DBT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc97Q9DBT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc97Q9DBT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms