Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9DAE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9DAE8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DAE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9DAE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9DAE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9DAE8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DAE8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DAE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9DAE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9DAE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DAE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DAE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DAE8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DAE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DAE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DAE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DAE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DAE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DAE8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DAE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DAE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9DAE8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9DAE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DAE8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DAE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DAE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DAE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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