Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Exosc1Q9DAA6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc1Q9DAA6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc1Q9DAA6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Exosc1Q9DAA6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exosc1Q9DAA6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc1Q9DAA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc1Q9DAA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc1Q9DAA6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc1Q9DAA6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc1Q9DAA6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms