Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DAA3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAA3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DAA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9DAA3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAA3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAA3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAA3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAA3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms