Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lin37Q9D8N6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lin37Q9D8N6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lin37Q9D8N6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin37Q9D8N6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lin37Q9D8N6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin37Q9D8N6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin37Q9D8N6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms