Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Capn9Q9D805 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Capn9Q9D805 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn9Q9D805 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn9Q9D805 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Capn9Q9D805 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Capn9Q9D805 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn9Q9D805 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Capn9Q9D805 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Capn9Q9D805 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capn9Q9D805 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Capn9Q9D805 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Capn9Q9D805 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn9Q9D805 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn9Q9D805 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn9Q9D805 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Capn9Q9D805 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms