Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Cldn22Q9D7U6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Cldn22Q9D7U6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Cldn22Q9D7U6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Cldn22Q9D7U6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Cldn22Q9D7U6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cldn22Q9D7U6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Cldn22Q9D7U6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Cldn22Q9D7U6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Cldn22Q9D7U6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Cldn22Q9D7U6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
Cldn22Q9D7U6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Cldn22Q9D7U6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Cldn22Q9D7U6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Cldn22Q9D7U6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Cldn22Q9D7U6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms