Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A8

Armc1, Armadillo repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Armc1Q9D7A8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Armc1Q9D7A8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Armc1Q9D7A8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Armc1Q9D7A8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Armc1Q9D7A8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Armc1Q9D7A8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Armc1Q9D7A8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Armc1Q9D7A8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Armc1Q9D7A8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Armc1Q9D7A8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Armc1Q9D7A8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Armc1Q9D7A8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Armc1Q9D7A8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Armc1Q9D7A8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Armc1Q9D7A8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms