Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsf13Q9D777 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf13Q9D777 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13Q9D777 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf13Q9D777 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsf13Q9D777 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsf13Q9D777 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsf13Q9D777 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf13Q9D777 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13Q9D777 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms